Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSK8

Rps6kb1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kb1Q8BSK8 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rps6kb1Q8BSK8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rps6kb1Q8BSK8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rps6kb1Q8BSK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms