Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSF5

Klhl38, Kelch-like protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl38Q8BSF5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl38Q8BSF5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klhl38Q8BSF5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klhl38Q8BSF5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms