Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjd4Q8BSD4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gjd4Q8BSD4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gjd4Q8BSD4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gjd4Q8BSD4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gjd4Q8BSD4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms