Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQN5

Fam78b, Protein FAM78B, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam78bQ8BQN5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam78bQ8BQN5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fam78bQ8BQN5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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