Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TicrrQ8BQ33 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TicrrQ8BQ33 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TicrrQ8BQ33 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms