Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMV6

E130116L18Rik, RIKEN cDNA E130116L18 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130116L18RikQ8BMV6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
E130116L18RikQ8BMV6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
E130116L18RikQ8BMV6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms