Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH01

Tmco3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco3Q8BH01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmco3Q8BH01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tmco3Q8BH01 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms