Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Bhlhe23Q8BGW3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Bhlhe23Q8BGW3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bhlhe23Q8BGW3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms