Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGJ9

U2af1l4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af1l4Q8BGJ9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
U2af1l4Q8BGJ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
U2af1l4Q8BGJ9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
U2af1l4Q8BGJ9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms