Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrtm2Q8BGA3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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