Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pknox2Q8BG99 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox2Q8BG99 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox2Q8BG99 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms