Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Necab1Q8BG18 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Necab1Q8BG18 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Necab1Q8BG18 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms