Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Liat1Q810M6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Liat1Q810M6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Liat1Q810M6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.9 ms