Protein–RNA interactions for Protein: Q80X59

Tmco5b, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5bQ80X59 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmco5bQ80X59 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tmco5bQ80X59 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmco5bQ80X59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
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