Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc1Q80VQ1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc1Q80VQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc1Q80VQ1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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