Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rpp38Q80UU2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rpp38Q80UU2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rpp38Q80UU2 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms