Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Avl9Q80U56 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Avl9Q80U56 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Avl9Q80U56 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms