Protein–RNA interactions for Protein: Q80ST9

Lca5, Lebercilin, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lca5Q80ST9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lca5Q80ST9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lca5Q80ST9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lca5Q80ST9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms