Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ube2q1Q7TSS2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ube2q1Q7TSS2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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