Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Actn1Q7TPR4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Actn1Q7TPR4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Actn1Q7TPR4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms