Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ShprhQ7TPQ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
ShprhQ7TPQ3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
ShprhQ7TPQ3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
ShprhQ7TPQ3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms