Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Znf250Q7TNU6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Znf250Q7TNU6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf250Q7TNU6 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf250Q7TNU6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf250Q7TNU6 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf250Q7TNU6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Znf250Q7TNU6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms