Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMM8

Parp16, Mono [ADP-ribose] polymerase PARP16, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp16Q7TMM8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp16Q7TMM8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp16Q7TMM8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp16Q7TMM8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp16Q7TMM8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Parp16Q7TMM8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Parp16Q7TMM8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Parp16Q7TMM8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms