Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TwistnbQ78WZ7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TwistnbQ78WZ7 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TwistnbQ78WZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms