Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rph3alQ768S4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rph3alQ768S4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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