Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Sned1Q70E20 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Sned1Q70E20 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sned1Q70E20 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms