Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms