Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
RfflQ6ZQM0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
RfflQ6ZQM0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms