Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQK0

Ncapd3, Condensin-2 complex subunit D3, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd3Q6ZQK0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Ncapd3Q6ZQK0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ncapd3Q6ZQK0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Ncapd3Q6ZQK0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ncapd3Q6ZQK0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms