Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ89

March6, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH6, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March6Q6ZQ89 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
March6Q6ZQ89 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
March6Q6ZQ89 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
March6Q6ZQ89 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms