Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Smg5Q6ZPY2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Smg5Q6ZPY2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms