Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LcorQ6ZPI3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LcorQ6ZPI3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms