Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Slc44a1Q6X893 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slc44a1Q6X893 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slc44a1Q6X893 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms