Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cxcl3Q6W5C0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cxcl3Q6W5C0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cxcl3Q6W5C0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms