Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
Rhox8Q6VSS7 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Rhox8Q6VSS7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.67■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Rhox8Q6VSS7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
Rhox8Q6VSS7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms