Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Cd300ld3Q6SJQ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms