Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Ccdc154Q6RUT8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc154Q6RUT8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms