Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nudcd1Q6PIP5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Nudcd1Q6PIP5 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms