Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gramd2bQ6PEM6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gramd2bQ6PEM6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms