Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDZ2

Taf1c, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1cQ6PDZ2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Taf1cQ6PDZ2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Taf1cQ6PDZ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Taf1cQ6PDZ2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms