Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vstm2lQ6PDS0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vstm2lQ6PDS0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms