Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SvoplQ6PDF3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SvoplQ6PDF3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SvoplQ6PDF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms