Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Trak1Q6PD31 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Trak1Q6PD31 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Trak1Q6PD31 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms