Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RgmaQ6PCX7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RgmaQ6PCX7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RgmaQ6PCX7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RgmaQ6PCX7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms