Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Herc4Q6PAV2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Herc4Q6PAV2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms