Protein–RNA interactions for Protein: Q6P902

Txndc2, Thioredoxin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txndc2Q6P902 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Txndc2Q6P902 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Txndc2Q6P902 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Txndc2Q6P902 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txndc2Q6P902 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Txndc2Q6P902 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txndc2Q6P902 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Txndc2Q6P902 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1363.3 ms