Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
BC061212Q6P8K3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BC061212Q6P8K3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 859.3 ms