Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc148Q6P5U8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc148Q6P5U8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc148Q6P5U8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms