Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T1

Snx19, Sorting nexin-19, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx19Q6P4T1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Snx19Q6P4T1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Snx19Q6P4T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms