Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Atg2aQ6P4T0 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Atg2aQ6P4T0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms